針對某網站新聞發布有關恙蟲病、腸病毒、腺病毒接連席捲澎湖各國中小及托兒所的發言報導，衛生局澄清表示，每年會嚴重威脅嬰幼童健康的腸病毒，在天氣轉熱後，雖然全台疫情正處於流行高峰期，並造成1例重症死亡，但本縣腸病毒疫情今年從一月至今累積各醫院、診所陸續通報個案共計120位病例，已是近5年來同期是相對的低，都在控制之中，亦無腸病毒重症確定病例，請民眾無須恐慌。學齡前嬰幼兒是重症的高危險群，衛生局再次呼籲嬰幼兒照顧者一定要注意衛生習慣以及防護措施。如果與大朋友學習環境沒完全區隔，就容易引發腸病毒群聚感染，將把這些幼托園所列入最為重點的防疫場所。
另外，本縣近來成人最常見的感冒病毒，主要是以 A型流行性感冒為主，而在嬰兒呼吸道感染中，腺病毒是幼兒常見感染的病毒，尤其夏天和冬天是流行高峰期，主要是透過飛沫和接觸傳染，當含有病毒的微粒接觸到易受感染的人群的鼻子、喉嚨或眼結膜的黏膜時，便容易感染，另一個傳染途徑是經由口–糞傳染，流行病學顯示這種徵候群最常與被污染的游泳池水有關，症狀包括發燒、喉嚨痛、扁桃腺化膿等，除了上呼吸道的感染，腺病毒也是造成孩童腹瀉的主要病因，其中也有一到兩成會合併結膜炎、又稱為紅眼症，因傳染力很強，常常家中一人感染、全家都受害，因此，呼籲出入公共場所還是多注意孩童的保護，以避免感染。
台灣的恙蟲病病例主要分布在山地離島縣市。本縣因地理環境特性及中老年人從事耕種人口較多，恙蟲病例數一直居高不下，前年恙蟲病個案122人次，經疫情調查資料顯示，大部分個案都有到菜園、田地或草叢等活動史。去年爭取縣府預算45萬執行滅鼠相關防疫措施後，去年已降至96例，今年截至目前為止全國1-6月累積67例以台東縣18人最多，宜蘭13人次之，本（104）年1-6月止在相關單位供同努力下，目前共計11例（馬公市3例、湖西鄉8例），衛生局不時透過村里衛教及廣播等方式加強宣導民眾自我防護措施，以避免感染恙蟲病，除此之外，恙蟲病感染途徑為在高溫潮濕且雜草叢生處，呼籲相關單位及民眾加強環境之除草及滅鼠工作，亦是防治恙蟲病最重要的必要措施，以避免野生小哺乳動物和恙?會共同形成流行島。
衛生局呼籲，近來網路上的社群軟體甚為方便，常有不實訊息流傳，尤其是最近MERS-CoV（中東呼吸症候群冠狀病毒感染症）鬧的沸沸揚揚，對此，衛生局表示，MERS-CoV疫情，疾管署都會以透明公開的態度予以說明，並於官網公布，供各界查詢，民眾散播不實疫情行為，已涉嫌違反傳染病防治法，利用傳播媒體發表傳染病流行疫情有錯誤、不實，致嚴重影響整體防疫利益或有影響之虞，可依第六十四條裁處新臺幣九萬元以上四十五萬元以下罰鍰，呼籲民眾切勿以身觸法。
